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发布时间:2023-04-27 15:16:44 人气:13 来源:铝单板厂家

转自:诺唯赞生物

一、测试方案  概  述  

诺唯赞基于TruePrep Flexible DNA Library Prep Kit for Illumina(Vazyme #TD504)和TruePrep RNA Library Prep Kit for Illumina(Vazyme #TR501/TR502/TR503)

分别构建了模拟感染样本的转座酶DNA文库(293细胞gDNA模拟宿主核酸背景且分别掺入不同比例的Zymo #D6322微生物DNA标准品)和转座酶RNA文库(293细胞Total RNA模拟宿主核酸背景且分别掺入不同比例的微生物RNA),这两种文库下文中以

微生物DNA文库和微生物RNA文库简述。使用华大智造MGISEQ-2000和DNBSEQ-G99测序仪对构建好的微生物DNA文库和微生物RNA文库进行测序。

表1. 微生物DNA文库构建方案注:Zymo #D6322由2%的Sac. cerevisiae和均占比14%的Staphylococcus aureus、Escherichia coli、Listeria monocytogenes

、Pseudomonas aeruginosa、Enterococcus faecalis、Salmonella enterica、Bacillus subtilis共计8种微生物DNA组成

表2. 微生物RNA文库构建方案二、测试结果 1. 测序数据质量表现优异微生物DNA文库和微生物RNA文库在MGISEQ-2000和DNBSEQ-G99测序下的数据质量好,Clean Q30均能达到90%以上。

图1. 微生物DNA文库在MGISEQ-2000和DNBSEQ-G99测序下的数据质量

图2. 微生物RNA文库在MGISEQ-2000和DNBSEQ-G99测序下的数据质量2. 微生物检出灵敏微生物DNA和微生物RNA文库在MGISEQ-2000和DNBSEQ-G99测序下的微生物检出reads数与实际掺入基本一致,两测序仪器对微生物DNA和微生物RNA

在1/10000掺比下均能有效检出。

图3. 微生物DNA文库在MGISEQ-2000和DNBSEQ-G99测序下微生物检出情况

图4. 微生物RNA文库在MGISEQ-2000和DNBSEQ-G99测序下微生物检出情况 总  结  Vazyme #TD504构建出的微生物DNA文库和Vazyme #TR501/TR502/TR503

构建出的微生物RNA文库在MGISEQ-2000和DNBSEQ-G99两款测序仪器上均能实现微生物1/10000掺比下的灵敏检出,并且文库测序数据表现优异三、解决方案诺唯赞mNGS转座酶建库解决方案  。

病原微生物引起的感染性疾病发病速度快、危害性强,快速确认重症感染患者所染病原体是临床进行有效治疗的关键mNGS技术不依赖传统微生物培养,直接对核酸进行高通量测序,为临床样本病原微生物检测提供更快速、更准确。

的方式。围绕临床病原样本mNGS检测的迫切市场需求,诺唯赞精心打磨、提供更专业的产品与解决方案,助力临床诊疗。

华大智造DNBSEQ-G99测序平台 

华大智造的DNBSEQ-G99以快速测序著称,PE150测序仅需12个小时,SE100测序5个小时内即可完成,同时,G99也具备简单性和灵活性,双载台设置、双模运行模式、全新的卡式测序载片和一体化的测序试剂盒,

助力解放双手,为客户带来更佳测序体验。

诺唯赞与华大智造发挥各自技术平台优势,联合进行转座酶DNA&RNA文库测评,为mNGS建库测序提供更便捷的选择作为国产高通量测序领域引领性企业,诺唯赞将立足客户需求,持续开发专业、前沿的NGS产品及解决方案,推动基因测序发展、助力临床诊疗!。

四、订购信息

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